Ổ USB có thể gây ra các mối đe dọa bảo mật đáng kể thông qua phần mềm độc hại. Chuyên gia khuyến cáo nên tránh sử dụng các ổ USB không rõ nguồn gốc và kiểm tra chúng trên một máy tính an toàn. Ngoài ra cần đề phòng mã độc, gián điệp và ransomware có trên một số loại USB.
